战后打扫战场，缴获的各类兵器铠甲约五万件，这大概就是这次歼敌的人数了，战马绝大部分都死伤，只能充作食物了。还能继续使用的也就3600多匹，归入了辎重营驮运货物。
锻炼军队的目的已经达到了，也就不必客气了。当天晚上，沈飞亲率200个记名弟子带着毒火喷筒出发，对敌军大营进行了金蚕蛊毒的毒气攻击，听到敌营中响起了此起彼伏，连绵不绝的惨号声之后就果断撤离。
中了金蚕蛊毒会用不出一点力气，惨号七天七夜才死，戴上口罩的记名弟子虽然可以防毒，现场补刀也办得到。不过毕竟不知道毒性的传染广度，万一被没有中毒的大队敌军合围难免出现伤亡，这样的高手战队损伤一个都舍不得，打扫战场可以第二天再去。
金蚕蛊毒的特性是碰一下中毒者也会中毒，不过元军不知道，要试错中得知这一点少说也要有四五个救助者中招以后，也就是这波攻击伤亡至少会扩大四五倍，接下来就是等战果了。休息了一晚，到第二天早上，沈飞再带昨晚出击的200个记名弟子出发前往敌营查看，走近了才发现密密麻麻躺了一地元军发出轻微沙哑的呻吟，粗粗一看地上大概有四千多人，看来惨号了一夜已经叫不动了。
还有少数敌军看装束明显与大部分人不同，稍微一想也就明白了，多半是其他营地的元军听到声音误以为炸营，过来查看情况，也就中招成了倒霉蛋。其他元军已经没了，多半是被这种诡异的手段吓跑了。于是下令补刀，上化尸粉，然后一把火烧掉剩下的沾毒铠甲兵器，半个小时后打扫完了战场。
储存的金蚕蛊毒还够发起四次这种规模的东西，不过染毒的战胜品也不能用了，这只能作为特殊的威慑手段，没有特殊情况沈飞是不打算再用了。这次击溃了主力元军极为振奋士气，趁机对西路红巾军进行收编。
之前大刀敖和白不喜重伤昏迷之后，西路红巾军支持不住元军的围攻都已经准备分散突围了。总坛红巾军突然杀出，击溃元军，战力之强让他们惊为天人，加上已经醒来的大刀熬和白不信也在感激之下极力配合，在军中明教弟子的支持下，五万人马收编非常顺利。
沈飞没有时间马上对他们进行训练，把元军骑兵散落的兵器粮草都交给了他们，让他们先跟在后面行军，此举更是获得了他们的感激。沈飞继续在前方持刀开路，经过两天到了之前没有攻下的凤翔，又发起了进攻。
光明顶本部红巾军虽然人数没有之前围攻的西路红巾军多，可是攻城器械齐全，见到三十多架回回炮出现在战场上，150斤重的石弹像下雨一下带着巨响落在城头和城中时，守军和跟在后面的西路红巾军都惊呆了，绝没有想到会有这么多大杀器。出城攻击想摧毁回回炮的几波元军被燧发枪、火箭车、连发小型投石机、连发床弩的弹风箭雨击溃，退入了城中龟缩了起来。
之后经过几天连续不断的攻击，当回回炮石弹干翻了城墙上的守军，车载“无敌大将军炮”轰开了城门以后，锐金、烈火、洪水三旗首先突入城中，鸳鸯阵战队再以“一头两翼一尾”队形跟进，明教高手、记名弟子和葵花卫也一起出击，经过三个小时的城中巷战，清理了残敌，完全拿下了凤翔。只是有大约4000多敌军见到事不可为，逃出了城去。
过了半天，后面的五万西路红巾军也进入了城中，凤翔本来就是陕西四川两省元军司令部的所在地，里面本来就储备了大量的军事装备来不及运走，加上败军散落在战场上的兵器和尸体上的铠甲，经过两天的清点整理，给所有军队人手一件长短兵器铠甲还多出四万多件，称得上超级大丰收。
接下来就开始对城中的接收和五万西路红巾军的整编，之前的收编只是取得了名义上的领导权，这时就是趁着攻克凤翔的巨大威望进行军事训练，办法还是派出教官团对全军分散训练，同时接收原来凤翔元军的军工体系。
这时对于元庭来说，发生了一件比凤翔失陷更大的事情，刘福通率军攻克了宋朝旧都汴梁后，把本来在安徽的郭子兴、郭天叙父子接过去正式称帝，以宋为国号。消息一传开，举国振动，红巾军声势如日中天。